Avfall fra GMO skal behandles som biologisk avfall og betraktes som risikoavfall. Dette gjelder både fast og flytende avfall.
Avfall fra GMO i klasse 3 og 4 skal inaktiveres før det plasseres i gule risikoavfallsposer.
Inaktivering skjer ved autoklavering i 1 time ved 121 grader, alternativt ved bruk av Virkon 1-3%, eller 5% hypokloritt.